DNA拷贝数的计算方法

DNA拷贝数的计算方法

1A260 吸光度值＝ds DNA 50 ug/ml=ss DNA 33 ug/ml=ss RNA 40 ug/ml

核酸浓度＝(OD260) x (dilution factor) x [33 或40或50]= ng/ul

MW 代表 克/摩尔，单位dolton：1dolton即表示 1g/mol

1 摩尔= 6.02 x 10(23)次摩尔分子(拷贝数)

平均分子量（MW）:

dsDNA=(碱基数) x (660 道尔顿/碱基)

ssDNA=(碱基数) x (330 道尔顿/碱基)

ssRNA=(碱基数) x (340 道尔顿/碱基)

得到拷贝数计算公式:

(6.02 x 10(23)次拷贝数/摩尔) x (浓度) / (MW g/mol) = copies/ml.

即：

(6.02 x 10(23)) x (g/ml) / (DNA length x 660) = copies/ml.

或

(6.02 x 10(23)) x (ng/ul x 10(-9) ) / (DNA length x 660) = copies/ul.

例：

3000 碱基质粒，浓度100 ng/ul ，MW= 3000 bp x 660 dalton/bp =1.98 x 10(6) daltons，即1 mol =1.98 x 10(6) g。

[ 100ng x 10(-9) ] g / 1.98 x 10(6) ＝ 摩尔数 copy数＝ 摩尔数 x 6.02 x 10(23)＝ 3x 10(10) copies/ul.

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