网上可以办理港澳通行证。网上办港澳通行证流程是：打开所属市的公安局出入境便民网。在个人业务中，已有通行证的，申请往来港澳个人旅游签注应点击已有通行证，然后进入申请协议书页面，阅读申请协议书后选择接受。根据自己的实际情况填完个人信息，最后确认提交，提交后等快递来取港澳通行证。
《中华人民共和国出境入境管理法》
第十条
中国公民往来内地与香港特别行政区、澳门特别行政区，中国公民往来大陆与台湾地区，应当依法申请办理通行证件，并遵守本法有关规定。具体管理办法由国务院规定。
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