申请破产后的债务由破产公司所剩余的破产财产进行清偿，破产财产不足以满足清偿要求的，应当按比例分配。破产财产的清偿顺序是破产费用、共益债务、债务人因不正当利益而产生的债务等。偿还债务有剩余由全体股东按照出资比例或公司章程规定分配。
法律依据：
《中华人民共和国公司法》 第三条 公司是企业法人，具有独立的法人财产，享有法人财产权。公司以其全部财产对其债务承担责任。有限责任公司股东以其认缴的出资额对公司承担责任；股份有限公司股东以其认缴的股份对公司承担责任。
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