法律分析：强奸罪一般要证明两点：一是发生了性关系;二是违背了妇女的意志。证据就要围绕这两点形成证据锁链。可以从女方处提取遗留精斑或残留精液，通过司法机关鉴定精子的似然比，鉴定机关根据这个似然比来确定是否是实施强奸的男性所为;这就证明了第一个问题。至于违背妇女意志，主要还是被害人的陈述，当然如果有犯罪嫌疑人自己的供述则更好。法律依据：《刑法》第五十五条对一切案件的判处都要重证据，重调查研究，不轻信口供。只有被告人供述，没有其他证据的，不能认定被告人有罪和处以刑罚;没有被告人供述，证据确实、充分的，可以认定被告人有罪和处以刑罚。
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