《民法典》规定，土地补偿等费用的使用分配办法应当依照法定程序经本集体成员决定。《村民委员会组织法》也规定，对于征地补偿费的使用和分配方案需要经村民会议讨论决定，村民也可以委托代表进行。村民委员会和村务监督机构应当将征地补偿费使用及分配方案等建立村务档案。事实上，截留部分补偿款也都是通过村民会议或者村民代表大会决定的。当然也有其他情况，比如村委会会议承包经营权证上登记的面积和实际面积不符而扣发一部分费用。
但是，村民会议作出分配决议应当遵循法律的规定，如村民会议由本村十八周岁以上的村民组成，召开村民会议，应当提前十天通知村民，有本村十八周岁以上村民的过半数，或者本村三分之二以上的户的代表参加，村民会议所作决定应当经到会人员的过半数通过。这些法定程序的设计有利于保证农民对涉及自身权益的事情上能够有充分的自主参与权。
一、补偿费用的管理归属
（一）各项补偿费用由被征地单位收取后，按如下方式处理：
1、土地补偿费、依法应支付给集体的安置补助费、集体所在的青苗补偿费和附着物补偿费，由被征地单位管理和使用。
2、青苗补偿费和附着物补偿费归青苗和附着物的所有者所有。
3、安置补助费的归属、使用：
（1）由农村集体经济组织安置的，支付给农村集体经济组织，由其管理和使用。
（2）由其他单位安置的，支付给安置单位。
（3）不需要统一安置的，发放给安置人员个人或经被安置人员同意后用于支付被安置人员的保险费用。
（二）集体所有的补偿费用的使用收益分配办法：
1、在当地金融机构设立专户存放。
2、使用情况公开，接受村民监督。
3、分配办法经村民会议或村民代表会议过半数通过，报乡政府备案。
二、补偿费用的管理、归属
(一)各项补偿费用由被征地单位收取后，按如下方式处理：
1、土地补偿费、依法应支付给集体的安置补助费、集体所在的青苗补偿费和附着物补偿费，由被征地单位管理和使用。
2、青苗补偿费和附着物补偿费归青苗和附着物的所有者所有。
3、安置补助费的归属、使用：
(1)由农村集体经济组织安置的，支付给农村集体经济组织，由其管理和使用。
(2)由其他单位安置的，支付给安置单位。
(3)不需要统一安置的，发放给安置人员个人或经被安置人员同意后用于支付被安置人员的保险费用。
(二)集体所有的补偿费用的使用收益分配办法：
1、在当地金融机构设立专户存放。
2、使用情况公开，接受村民监督。
3、分配办法经村民会议或村民代表会议过半数通过，报乡政府备案。
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