当管理者认为某个行政部门的行为有问题时，可以提出异议。通常情况下，提出异议的具体步骤如下：
1.明确异议内容：首先需要明确对行政行为的哪些方面提出异议，比如是否符合法律法规、是否合理公平等。
2.查阅相关法律法规：在提出异议之前，需要对相关的法律法规进行仔细的查阅和分析，确保自己的异议有法律依据。
3.书面提出异议：一般情况下，需要以书面形式向相关行政部门提出异议，内容要清晰具体，陈述理由、依据，并提出自己的诉求。
4.寻求支持：如果觉得需要更多的支持，可以寻求专业律师或相关组织的帮助，他们可以为你提供法律咨询和支持。
5.跟踪处理情况：提出异议后，需要及时跟踪处理情况，保持沟通，了解异议处理的进展情况。
总的来说，提出异议是一种合法的维护自身权益的方式，但在提出异议之前需要做好充分的准备工作，确保自己的异议有充分的依据和理由，并且要善于沟通协商，争取最终的合理解决方案。